Во исполнение распоряжения Президента Российской Федерации № 440-рсп от 30 сентября 1995 г. Межведомственная комиссия по защите государственной тайны приняла решение № 32 рс от 31 августа 1998 г. "О порядке рассекречивания документов фондов Советской военной администрации в Германии. 1945-1949 гг." и создании с этой целью специальной Комиссии "для реализации Программы изучения и издания документов СВАГ, хранящихся в федеральных государственных и ведомственных архивах". В результате работы Комиссии рассекречено полностью 6384 дела и частично - 645 дел.
В фонде Р-7317 (Советская военная администрация в Германии) полностью или частично рассекречены дела секретариатов первого заместителя и заместителя Главноначальствующего СВАГ по экономическим вопросам, Штаба СВАГ (общий, автомобильный, финансовый, торгово-бытовых предприятий и политический отделы, Политуправления (военный и военно-морской отделы), научно-техническое бюро гидрометслужбы при Военном управлении СВАГ, управлений - по изучению достижений и техники Германии, военного, по экономическому разоружению Германии, внешней торговли, репараций и поставок, по репатриации и розыску граждан Объединенных наций, финансового, планово-экономического, материально-технического обеспечения, металлургической, химической, угольной, полиграфической промышленности и электростанций, легкой промышленности, сельского хозяйства и лесоводства, торговли и снабжения, транспорта, связи, информации, издательств и книжной торговли; отделов - декартелизации, контроля над бывшим акционерным обществом "И.Г.Фарбениндустри", организационно-учебного, кадров, рабочей силы, правового, народного образования и здравоохранения, а также материалы по личному составу СВАГ.
Значительную часть рассекреченных дел этого фонда составляют личные дела политических, государственных и общественных деятелей Германии, заведенные в Союзной Контрольной Комиссии (3202 дела) и материалы по кадрам демократических партий, общественных организаций, министерств и ведомств, отраслей экономики Германии
(41 дело).
В фондах управлений Советской военной администрации земель - Бранденбурга (ф. Р-7077), Мекленбурга (ф. Р-7103), Саксонии-Ангальт
(ф. Р-7133), Тюрингии (ф. Р-7184), Саксонии (ф. Р-7212) рассекречена большая часть дел канцелярий, штабов и уполномоченных по военным заказам.
Рассекречены также документы фондов: Р-7375 - Дирекция железных дорог и водных путей сообщения СВАГ (объединенный фонд), который содержит делопроизводство уполномоченных Транспортного управления СВАГ при дирекциях германских железных дорог и водных путей сообщения; Р-7399 - Начальник тыла Группы советских оккупационных войск в Германии (политотдела Управления комендантской службы ГСОВГ и отдела демонтажа и отгрузки при начальнике тыла).
Большое количество дел (755) рассекречено в фонде Р-9409 - Отдел специальных лагерей МВД СССР в Германии за 1945-1950 гг. Это дела секретариата, оперативного отделения, отделений охраны, режима и учета, кадров, финансового, хозяйственного, санитарного, учетного), а также спецлагерей № 1, 2, 3, 4, 6, 9, 10.
Рассекречены дела редакций и издательств газет: "Советское слово" (ф. Р-9433), "Теглихе Рундшау" (ф. Р-7408), советских школ в г.Берлине (фонд-коллекция Р-9227), Дома культуры СССР в г.Берлине (ф. Р-9434), Центрального клуба СВАГ (Ф. Р-9435), Конторы спецторговли продовольственными товарами (ф. Р-9436), первичных парторганизаций управлений и отделов СВАГ (ф. Р-5704), первичных комсомольских организаций СВАГ (ф. Р-5707).
Рассекречены также дела Центральной ликвидационной комиссии СВАГ (ф. Р-7405).
В РГАСПИ (бывший Центральный партийный архив Института марксизма-ленинизма при ЦК КПСС) рассекречены 155 дел из фонда 17 (ЦК КПСС) по Управлению кадров ЦК ВКП(б), Административному отделу и Отделу международной информации (Внешнеполитической комиссии) ЦК ВКП(б), касающихся деятельности СВАГ.